神农架已初步查明有高等维管束植物199科872属3183种，真菌、地衣共927种；其中属于国家重点保护植物有76种，如珙桐、光叶珙桐，连香树、水青树、香果树等；属于神农架鄂西特有植物42种，如汉白杨、红坪杏等。药用植物超过1800多种，以“天然药园”驰名中外。神农架现有脊椎动物493种，占湖北省脊椎动物总种数的57.5%。其中哺乳纲7目22科75种，鸟纲16目48科308种，爬行纲2目8科27属40种，两栖纲2目7科23种，鱼纲4目10科32属47种，分别占湖北省同类总数的61.9%、71.5%、68.9%、50.0%、23.4%。神农架蕴藏着丰富的昆虫资源，计有28目157科4143种。有国家重点保护**73种。此外，还先后发现了30多种白化动物，如白林麝、白鬣羚、白蛇、白熊等。白化动物多也是区内动物资源的一个鲜明特点。（数据截至2013年）